Sousuke Sagara est un jeune soldat d'élite de Mithril, un groupe aux technologies très avancées. Il reçoit pour mission de protéger Kaname Chidori, une lycéenne qu'on soupçonne d'être une « whispered ». Au cours d'un voyage de classe, l'avion qu'ils ont pris est détourné, et un groupe ennemi kidnappe Kaname. Elle ignorerait qu'elle avait effectivement inconsciemment des connaissances précises sur les plus puissantes armes de guerre. Après l'avoir sauvée, Sousuke doit ainsi la protéger de nouvelles attaques terroristes, mais doit pour cela rester au lycée de Kaname, et peu habitué à la vie en communauté, il va rendre la vie de celle-ci plutôt mouvementée.
Full Metal Panic! (フルメタル・パニック!)
24 épisodes de 25 minutes
2001
Sousuke rencontre Kaname pour sa mission. Il va la protéger de plusieurs attaques terroristes.
Full Metal Panic? Fumoffu (フルメタル・パニック? ふもっふ)
11 épisodes de 25 minutes
2002
Sousuke va au lycée avec Kaname. N'ayant aucun sens commun, il voit le danger partout et va transformer le lycée en un véritable champ de bataille.
Full Metal Panic? Fumoffu Special
2 épisodes de 10 minutes
2003
Deux petites histoires comparables aux autres épisodes de cette saison.
Full Metal Panic! The Second Raid (フルメタル・パニック! The Second Raid)
13 épisodes de 25 minutes
2005
Un groupe de terroristes, composé de membres très dangereux, semble être intéressé par l'Arbalest, le robot piloté par Sousuke, capable d'activer le Lambda Driver.
Full Metal Panic! The Second Raid OAV
1 OAV de 30 minutes
2006
Tessa se réveille un matin sans se souvenir de ce qu'elle a fait la veille : elle ne retrouve plus sa peluche.