Dans le passé, Kenshin était le battousai, un samouraï extrêmement puissant qui a tué un grand nombre de personnes. Dix années plus tard, Kenshin a décidé de ne plus tuer, et est devenu un vagabond, jusqu'au jour où il rencontre Kaoru, chez qui il va désormais habiter. Mais le passé de Kenshin ne peut être effacé et d'anciens ennemis font sans cesse leur apparition...
La série TV est composée de 95 épisodes de 25 minutes. Elle peut être divisée en 4 parties :
Partie 1
Épisodes 1 à 27
Kenshin rencontre Kaoru, Yahiko et Sanosuke. Il devra se battre à plusieurs reprises.
Partie 2
Épisodes 28 à 66
Kenshin doit retourner à Kyoto pour affronter Shishio.
Partie 3
Épisodes 67 à 76
Kenshin doit combattre Shougo, un autre puissant ennemi qui semble avoir des pouvoirs divins, et utilisant le même style de combat que lui.
Partie 4
Épisodes 77 à 95
Plusieurs petites "missions".
Film
Ishinshishi e no Requiem
維新志士への鎮魂歌
Requiem pour les Ishin Shishi
90 minutes
1997
Au cours d'un voyage, Kenshin rencontre Shigure, un samouraï avec qui il se lie d'amitié. Mais celui-ci prépare une révolution, et c'est d'autre part l'ami d'un ancien samouraï tué par Kenshin.
OAV
Tsuioku Hen
追憶編
Le chapitre de la mémoire
4 OAV de 30 minutes
1997
L'histoire se passe des années avant le début de la série TV. On y apprend le passé de Kenshin, son amour pour Tomoe et l'origine de sa cicatrice.
OAV
Seisou Hen
星霜編
Le chapitre de la longue période
Le chapitre de l'expiation
2 OAV de 30 minutes
2001
L'histoire se passe quelques années après la fin de la série TV. Alors qu'elle est atteinte de la même maladie que Kenshin, Kaoru attend le retour de celui-ci. Elle se rappelle alors la fois où le frère de Tomoe apparut pour se venger.
OAV
Shin Kyoto Hen
新京都編
Le nouveau chapitre de Kyoto
2 OAV de 45 minutes
2011
Il s'agit d'un remake de la 2e partie de la série TV.